Lễ hội Kỳ yên đình Bình Thủy diễn ra vào các ngày 12, 13 và 14 tháng 4 âm lịch hàng năm. Lễ hội mở đầu bằng nghi thức Long xa du ngoạn vào rạng sáng 12/4; tiếp theo đó, nhiều nghi lễ truyền thống được tiến hành như Lễ Thay khăn sắc Thần, Lễ Tế Thần Nông, Lễ Tế Sơn Quân, Lễ Tôn Vương, Lễ Chánh Tế, Lễ Túc Yết... Lễ hội Kỳ yên còn có nhiều hoạt động văn hóa, thể thao như đua thuyền truyền thống, trò chơi dân gian, hát bội, hội thi mâm xôi ngọt, hội bánh dân gian... Trải qua hàng trăm năm, Lễ hội Kỳ yên đình Bình Thủy trở thành nét sinh hoạt văn hóa tâm linh đặc sắc, khẳng định những giá trị truyền thống lâu đời của đất và người Cần Thơ.