Theo đó, Đề án được triển khai thực hiện từ năm 2016-2020 và dự báo đến 2030. Trước mắt, giai đoạn 2016-2020, triển khai các hạng mục công trình thực hiện việc bảo tồn và phát triển Chợ nổi gồm: Bố trí phao phân luồng đảm bảo an toàn giao thông thủy; cải tạo an toàn hệ thống điện trên sông; tổ chức ghe thu gom rác đảm bảo vệ sinh môi trường; thực hiện các biện pháp truyền thông, tuyên truyền nâng cao nhận thức của người dân, thương hồ nâng cao ý thức bảo tồn chợ nổi và phát triển du lịch; hỗ trợ di dời 38 bè nổi đến nơi neo đậu an toàn, có sắp xếp; hỗ trợ cho vay ưu đãi cho các hộ đang kinh doanh ẩm thực, trái cây đảm bảo vệ sinh thực phẩm, xây dựng nhà vệ sinh công cộng trên sông...

Giai đoạn 2018 – 2020, nghiên cứu triển khai kêu gọi đầu tư các hạng mục công trình phục vụ cho việc phát triển chợ nổi gồm: xây dựng cầu tàu Chợ nổi, du thuyền (nhà hàng nổi trên sông), trạm dừng chân chợ nổi.

Năm 2020, thiết kế, xây dựng quầy hàng nổi trên sông (floating shop), nhà hàng nổi ven sông.

Tổng kinh phí thực hiện của Đề án khoảng 63 tỷ 560 triệu đồng, trong đó, kinh phí đầu tư từ nguồn Ngân sách nhà nước dự kiến là 13 tỷ 260 triệu đồng và kinh phí đầu tư từ nguồn xã hội hóa dự kiến là 50 tỷ 300 triệu đồng.

Mục tiêu của Đề án bảo tồn Chợ nổi Cái Răng nhằm bảo tồn di sản văn hóa phi vật thể của quốc gia đặc trưng văn hóa vùng sông nước (khai thác lợi ích văn hóa); phát triển Chợ nổi Cái Răng trong vai trò là đầu mối trung chuyển hàng nông sản của vùng theo hướng trên bến dưới thuyền đảm bảo an toàn giao thông đường thủy nội địa (khai thác lợi ích kinh tế); phát triển chợ nổi phục vụ phát triển du lịch sinh thái (khai thác lợi ích du lịch).