Cụ thể, Trung tâm Phục vụ hành chính công TP Cần Thơ thuộc Văn phòng Ủy ban nhân dân thành phố, có con dấu để thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn được giao; chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức, hoạt động của Văn phòng Ủy ban nhân dân thành phố; đồng thời chịu sự chỉ đạo của Ủy ban nhân dân thành phố, Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố và sự chỉ đạo, hướng dẫn về chuyên môn nghiệp vụ của các cơ quan nhà nước có thẩm quyền.

Về chức năng, Trung tâm đóng vai trò đầu mối tập trung tiếp nhận, hướng dẫn, cung cấp thông tin, cung ứng dịch vụ trong giải quyết và trả kết quả các thủ tục hành chính cấp thành phố theo bộ thủ tục hành chính được công bố theo thẩm quyền. Hướng dẫn, theo dõi, đôn đốc việc giải quyết hồ sơ, thủ tục hành chính cho cá nhân, tổ chức theo quy định; tham gia đề xuất các giải pháp nhằm cải cách thủ tục hành chính, hiện đại hóa nền hành chính, trong đó tập trung đơn giản hóa thủ tục hành chính và đẩy mạnh ứng dụng công nghệ thông tin nhằm tin học hóa các giao dịch hành chính trong giải quyết thủ tục hành chính và cung cấp các dịch vụ công trực tuyến tại Trung tâm.

Trung tâm Phục vụ hành chính công TP Cần Thơ có Giám đốc là 1 lãnh đạo Văn phòng Ủy ban nhân dân thành phố hoặc tương đương và không quá 2 Phó Giám đốc là 2 lãnh đạo cấp phòng thuộc Văn phòng Ủy ban nhân dân thành phố, do Chủ tịch Ủy ban nhân dân cấp thành phố quyết định bổ nhiệm.

Trụ sở của Trung tâm Phục vụ hành chính công TP Cần Thơ được bố trí tại vị trí thuận lợi kết nối các cơ quan chuyên môn thuộc Ủy ban nhân dân thành phố và các cơ quan Trung ương được tổ chức theo ngành dọc đóng trên địa bàn trong việc vận chuyển, tiếp nhận, giải quyết các thủ tục hành chính, ở vị trí trung tâm thành phố để thuận lợi cho các tổ chức, cá nhân đến giao dịch. Dự kiến trụ sở tại địa chỉ: số 02, đường Nguyễn Đình Chiểu, phường Tân An, quận Ninh Kiều, TP Cần Thơ.